Dies ist die Linux-App mit dem Namen MDcons (Molecular Dynamics Consensus), deren neueste Version als mdcons-src-2.0.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MDcons (Molecular Dynamics Consensus) mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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MDcons (Molekulardynamik-Konsens)
BESCHREIBUNG
MDcons ist ein Tool zur Analyse konservierter Kontakte während Molecular Dynamics (MD)-Simulationen von Protein-, Rna-, DNA- und Liganden-basierten Komplexen. Die Eingabe ist entweder eine Molecular Dynamics-Trajektorie oder eine Reihe von Schnappschüssen. Die Eingabe kann auch ein einzelner Snapshot sein. Die Ausgaben sind (1) eine Karte der am häufigsten/weniger häufig konservierten Kontakte während der MD (2) eine Liste der am häufigsten/weniger häufig konservierten Kontakte während der MD.
Eigenschaften
- MDcons läuft auf über 2000 MD-Snapshots in weniger als 2 Minuten
- MDcons verarbeitet sowohl Protein-, RNA- als auch DNA-Komplexe
- MDcons verarbeitet Flugbahnen/Schnappschüsse mit oder ohne Kettenkennung
- MDcons ist kompatibel mit GROMACS
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal, Befehlszeile
Programmiersprache
Fortran, Python
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mdcons/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
