Dies ist die Linux-App namens MPICorMat, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als MPICorMat_v3.0.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MPICorMat herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
MPICorMat kann unter Linux online ausgeführt werden
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BESCHREIBUNG
MPICorMat ist ein paralleles Tool zur Erstellung von Korrelationsähnlichkeitsmatrizen als Teil des Verfahrens zur Generierung von Gen-Koexpressionsnetzwerken. Dieses Tool verwendet als Eingabe eine Matrix mit den Expressionswerten (einen Float-Wert) für verschiedene Gene, die aus mehreren Proben beobachtet wurden. Es handelt sich um eine Parallelisierung des ersten Moduls des RMTGenNet-Tools (https://github.com/spficklin/RMTGeneNet). RMTGeneNet-Benutzer können dieses CCM-Modul durch MPICorMat austauschen und von der schnellen Berechnung zur Generierung der Ähnlichkeit profitierenMatrix und verwenden Sie dann die Ähnlichkeitsmatrix als Eingabe für das zweite Modul (RMM).
Konstruieren Sie das endgültige Gen-Koexpressionsnetzwerk.
Publikum
Informationstechnologie, Gesundheitswirtschaft, Wissenschaft/Forschung
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal, Befehlszeile
Programmiersprache
C + +
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mpicormat/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
