Dies ist die Linux-App namens PPSeq: Parallel NGS Analysis zur Ausführung unter Linux online, deren neueste Version als ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens PPSeq: Parallel NGS Analysis herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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PPSeq: Parallele NGS-Analyse zur Online-Ausführung unter Linux
BESCHREIBUNG
Die Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologie der nächsten Generation (NGS) hat sich in vielen Aspekten der biomedizinischen Forschung schnell zu einem leistungsstarken Werkzeug entwickelt. Zusammen mit seiner rasanten Entwicklung übersteigen die Datenmenge und die Analysekomplexität für NGS jedoch bei weitem die Kapazität und Leistungsfähigkeit herkömmlicher kleiner Computereinrichtungen, wie beispielsweise Multithreading-Algorithmen auf eigenständigen Workstations. Um dieses Problem anzugehen, stellen wir hier eine Lösung vor, die die ständig zunehmende Bereitstellung von Rechenleistung durch Massive Parallel Processing (MPP)-Systeme nutzt.Eigenschaften
- ppalgn - Abgleich von Sequenzierungs-Reads an langen Referenzsequenzen
- ppbwt - Aufbau eines FM-Index aus einer Reihe von DNA-Sequenzen
Publikum
Bildung, Ingenieurwesen, Gesundheitswirtschaft, Informationstechnologie, gemeinnützige Organisationen, Wissenschaft/Forschung
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
C + +
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/ppseq/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
