Dies ist die Linux-App namens SOAPsv, deren neueste Version als AsmSV.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens SOAPsv mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SOAPsv
BESCHREIBUNG:
Dies ist ein Ansatz, der frühere Methoden zur zuverlässigen Identifizierung homozygoter Strukturvariationen ergänzt. Unser Ansatz bestimmt den Genotyp und die Haltepunkte im Vergleich zu einem Referenzgenom genau, basierend auf der De-novo-Assemblierung der Sequenzierungsdaten des Illumina Genome Analyzer. Bei dieser Methode untersuchten wir nur homozygote Strukturvariationen, da der Nachweis heterozygoter Strukturvariationen die Assemblierung von Haplotypsequenzen erfordert, was mit vorhandenen Assemblern noch nicht möglich ist.
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
AWK, C++, Perl, Unix-Shell
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/soapsv/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.