Dies ist die Linux-App namens Tax4Fun2, deren neueste Version als Tax4Fun2_1.1.3.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Tax4Fun2 mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
Tax4Fun2
Ad
BESCHREIBUNG
Tax4Fun2 wird ständig weiterentwickelt und ersetzt das alte Tax4Fun (http://tax4fun.gobics.de/).Die neue Version wurde auf 275 archaealen und 12102 bakteriellen Genomen aufgebaut (Vollständiger oder Chromosomenstatus in RefSeq). Ich habe keine MAGs oder sehr unvollständige Genome aufgenommen, aber eine der wichtigsten Funktionen von Tax4Fun2 ist die Möglichkeit, Benutzerdaten zu integrieren (Prokaryoten und Eukaryoten werden unterstützt). Darüber hinaus haben wir eine Funktion zur Berechnung von (multi-)funktionalen Redundanzindizes hinzugefügt. Ich habe ein Beispiel hinzugefügt, wie Funktionsprofile und Funktionsredundanz vorhergesagt werden können. Für weitere Details: https://www.biorxiv.org/content/early/2018/12/09/490037 (Beachten Sie, dass dies ein Preprint ist und es noch kein Peer-Review gab).
Sie müssen NCBI BLAST+ auf Ihrem System installiert haben, bevor Sie es verwenden können. Für einige Funktionen müssen die R-Pakete ape und seqinr installiert sein.
Wenn Sie Probleme oder Fragen haben, kontaktieren Sie mich bitte ([E-Mail geschützt] ).
Eigenschaften
- Funktionsvorhersage aus 16S-rRNA-Daten
- Funktionale Redundanz
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/tax4fun2/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
