Dies ist die Linux-App namens Taxoblast, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als Taxoblast1.21beta.jar heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Taxoblast herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
Ad
Taxoblast läuft online unter Linux
BESCHREIBUNG
Rohe Genomsequenzen sind häufig mit Sequenzen anderer Organismen kontaminiert. Ihre Identifizierung ist für die Interpretation genomischer Daten unerlässlich. Dabei ist zwischen horizontalem Gentransfer und Kontamination zu unterscheiden. Der genomische Kontext von Sequenzen kann helfen, die beiden Szenarien zu unterscheiden. Taxoblast zerlegt genomische Gerüste in Teilsequenzen definierter Länge und bestimmt für jede von ihnen das am nächsten verwandte Taxon. Anschließend fasst es diese Informationen für das gesamte Gerüst unter Berücksichtigung der taxonomischen Ontologie zusammen. Gerüste, die ausschließlich mit potenziellen Verunreinigungen übereinstimmen, können sicher entfernt werden, während Sequenzen, die teilweise mit Verunreinigungen und teilweise mit dem Zielorganismus übereinstimmen, horizontale Übertragungen oder Montageartefakte darstellen und manuell untersucht werden müssen.Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Java-Schaukel
Programmiersprache
Javac
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/taxoblast/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
