Dies ist die Linux-App namens ViReMa, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als ViReMa_0.20.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens ViReMa herunter und führen Sie sie online aus, um sie online mit OnWorks kostenlos unter Linux auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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ViReMa läuft unter Linux online
BESCHREIBUNG
ViReMa (Viral Rekombination Mapper) erkennt und meldet Rekombinations- oder Fusionsereignisse in Virusgenomen mithilfe von Deep-Sequencing-Datensätzen.Feb 2014 - Unser Paper (Open Access) ist verfügbar bei Nucleic Acids Research:
„Entdeckung funktioneller genomischer Motive in Viren mit ViReMa – einem Virus Rekombination Mapper – zur Analyse von Sequenzierungsdaten der nächsten Generation“
http://nar.oxfordjournals.org/content/42/2/e11
Dies ist ein fortlaufendes Projekt und Updates werden regelmäßig veröffentlicht. Bitte melden Sie sich bei Fragen, Problemen oder Anregungen.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Python
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/virema/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
