Dies ist die Windows-App mit dem Namen 123VCF, deren neueste Version als 123VCF_binary.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App mit dem Namen 123VCF mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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123VCF
BESCHREIBUNG
123VCF wurde entwickelt, um den Filterschritt von VCF-Dateien zuverlässiger und effizienter zu gestalten.
Es kann im wichtigsten Schritt der Sequenzierung des gesamten Exoms und der Datenanalyse der Sequenzierung des gesamten Genoms in der Forschung und auch im klinischen Umfeld eingesetzt werden.
Es ruft nur die Filterungsauftragsdatei und die Variantendatei ab und filtert dann Varianten basierend auf dem, was Sie über die Filterungsauftragsdatei bestellt haben.
Benutzerhandbuch:
https://dl.adbioinformatics.net/123VCF/123VCF_Manual.ver1.pdf
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Autoren: Milad Eidi, Samaneh Abdolalizadeh, Soheila Moeini
Betreuer: Javad Zahiri, PhD – Masoud Garshasbi, PhD
Eigenschaften
- Grafische Benutzeroberfläche
- Einfach zu verwenden
- Einfach zu verstehen
- Komprimierte oder nicht komprimierte VCF-Dateien als Eingabe
- Überlebte Varianten im VCF-Format, tabulatorgetrenntes Format
- 123VCF stellt die gleichen BED-Merkmalsvarianten nebeneinander, wenn der Benutzer einen BED-Filter in einer TSV-Datei definiert, um mögliche zusammengesetzte heterozygote Varianten zu erkennen
Publikum
Bildung, fortgeschrittene Endbenutzer, Endbenutzer/Desktop, Tester
Benutzeroberfläche
Java-Schaukel
Programmiersprache
Javac
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/project123vcf/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, damit es auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt werden kann.
