Dies ist die Windows-App mit dem Namen „Automatische Zelllinienrekonstruktion“, die unter Windows online über Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als testData.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens „Automatische Zelllinienrekonstruktion“ herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Windows online über Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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Automatische Zelllinienrekonstruktion zur Ausführung unter Windows online über Linux online
BESCHREIBUNG
Aus Amat et al., Nature Methods, 2014*:„Die umfassende Rekonstruktion von Zelllinien in komplexen mehrzelligen Organismen ist ein zentrales Ziel der Entwicklungsbiologie. Wir präsentieren ein Open-Source-Rechenrahmenwerk für die Segmentierung und Verfolgung von Zellkernen mit hoher Genauigkeit und Geschwindigkeit. Wir demonstrieren seine (1) Allgemeingültigkeit durch Rekonstruktion Zelllinien in vierdimensionalen, Terabyte großen Bilddaten von Fruchtfliegen-, Zebrafisch- und Mäuseembryonen, aufgenommen mit drei verschiedenen Arten von Fluoreszenzmikroskopen, (2) Skalierbarkeit durch Analyse fortgeschrittener Entwicklungsstadien mit bis zu 20,000 Zellen pro Zeitpunkt , bei 26,000 Zellen min-1 auf einer einzelnen Computer-Workstation und (3) Benutzerfreundlichkeit durch Anpassung von nur zwei Parametern über alle Datensätze hinweg und Bereitstellung von Visualisierungs- und Bearbeitungstools für eine effiziente Datenkuratierung. Unser Ansatz erreicht eine durchschnittliche Verknüpfungsgenauigkeit von 97.0 % über alle Arten und Bildgebungsmodalitäten hinweg.
*Bitte zitieren Sie dieses Dokument, wenn Sie diesen Code für Ihre Recherche verwenden
Publikum
Wissenschaft/Forschung, Endbenutzer/Desktop
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal
Programmiersprache
C ++, c
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/tgmm/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
