Dies ist die Windows-App namens Calis-p, die unter Windows online über Linux online ausgeführt werden kann. Die neueste Version kann als calis-p-0.1.zip heruntergeladen werden. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Calis-p herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Windows online über Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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Calis-p läuft unter Windows online über Linux online
BESCHREIBUNG
Calis-p (The CALgary Approach to ISotopes in Proteomics) ist ein Softwarepaket zur direkten Extraktion stabiler Kohlenstoffisotopen-Fingerabdrücke (SIFs) einzelner Arten in einer mikrobiellen Gemeinschaft aus einem metaproteomischen Datensatz. Als Eingabe werden die bewerteten PSM-Tabellen (Peptide Spectrum Match) für Proben und das Kalibrierungsmaterial sowie die MS-Rohdaten im mzML-Format verwendet. Im ersten Schritt findet die Software die Isotopenpeaks für jedes PSM und summiert deren Intensitäten über ein festgelegtes Retentionszeitfenster. Die identifizierten Isotopenmuster (Paare aus m/z-Werten + summierten Intensitäten) werden zusammen mit der Summenformel der identifizierten Peptide gemeldet und als Eingabe für den zweiten Schritt von Calis-p verwendet, um Delta13C-Werte für alle Peptide zu berechnen, die einen Satz passieren von Filtern sowie durchschnittliche Delta13C-Werte und Standardfehler für jede Art. Die Delta13C-Werte der Spezies müssen für die Isotopenfraktionierung des Instruments korrigiert werden, indem der anhand des Referenzmaterials ermittelte Offset angewendet wird.Eigenschaften
- SIF-Daten werden direkt aus einem standardmäßigen metaproteomischen Datensatz extrahiert
- Ermitteln Sie effizient und zuverlässig SIF-Werte für eine große Anzahl von Arten in einer mikrobiellen Gemeinschaftsprobe im Hochdurchsatzverfahren.
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/calis-p/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
