Dies ist die Windows-App namens EigenMS, die unter Windows online über Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als EigenMS.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens EigenMS herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Windows online über Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
EigenMS läuft unter Windows online über Linux online
BESCHREIBUNG:
EigenMS ist eine in R (und ältere Version in Matlab) implementierte Normalisierungsmethode, die als Satz von zwei Funktionen verfügbar ist, die in einer Sequenz verwendet werden sollten.Bitte laden Sie die Datei EigenMS.zip (neueste Version) herunter.
Die neueste Version, die im Oktober 2017 hochgeladen wurde, enthält einen Bugfix für die Normalisierung von Einzelbehandlungsgruppen.
Die Neuskalierung wurde ab 2015 weggelassen.
EigenMS verwendet SVD, um Bias-Trends in den Daten zu erkennen und zu beseitigen. EigenMS eliminiert Effekte von bekannten und unbekannten Faktoren und kann für jede -omic-Plattform verwendet werden.
Wir haben seinen Nutzen in LC-MS/MS und Metabolomik in den folgenden zwei Veröffentlichungen gezeigt:
1) PMID: 19602524. "Normalisierung von Peakintensitäten in Bottom-up-MS-basierten Proteomik unter Verwendung von Singular Value Deposition".
Karpievitch YV, Taverner T, Adkins JN, Callister SJ, Anderson GA, Smith RD, Dabney AR.
Bioinformatik 2009
2) "Metabolomics-Datennormalisierung mit EigenMS"
Karpievitch YV, Nikolic SB, Wilson R, Sharman JE, Edwards LM.
PLoS One 2014
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
MATLAB, S/R
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/eigenms/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.