Dies ist die Windows-App mit dem Namen „High-Throughput Tabular Data Processor“, die unter Windows online über Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als HTDP.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App mit dem Namen „High-Throughput Tabular Data Processor“ herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Windows online über Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS:
Hochdurchsatz-Tabellendatenprozessor zur Ausführung unter Windows online über Linux online
BESCHREIBUNG:
HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR (HTDP) ist eine Java-Anwendung, die Datenexplorations- und -reduzierungsaufgaben in großen Textdateien erleichtern soll, die aus Hochdurchsatztechnologien resultieren, z. B. massiv parallele Sequenzierung oder Microarrays. Die Software wurde für Microarray- und Deep-Parallel-Sequencing-Daten optimiert, kann jedoch alle durch Zeichen getrennten Tabellendatensätze akzeptieren. HTDP kann auch Dateien im Variant Call Format (VCF) Version importieren, verarbeiten und konvertieren. 4.0, 4.1 und 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).HTDP bietet schnelle Filterfunktionen und kann Daten verarbeiten, die aus einzelnen oder mehreren Eingabedateien bestehen.
Zitat: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) High-Throughput Tabular Data Processor – Plattformunabhängiges grafisches Tool zur Verarbeitung großer Datenmengen. PLoS ONE 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Eigenschaften
- funktioniert mit allen durch Zeichen getrennten Spaltendaten (z. B. BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- Führen Sie tabellarische Datendateien vertikal und horizontal zusammen
- Führen Sie alle tabellarischen Datendateien anhand des Genomstandorts oder gemeinsamer Spalten zusammen.
- unbegrenzte Filter- und Datenreduzierungsfunktionen
- Es können unterschiedliche Dateien hinsichtlich Format und Inhalt gleichzeitig analysiert werden
Programmiersprache
Javac
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/htdp/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.