Dies ist die Windows-App namens ShuffleFastaSeq, deren neueste Version als ShuffleFastaSeq.exe heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens ShuffleFastaSeq mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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ShuffleFastaSeq
BESCHREIBUNG
ShuffleFastaSeq ist eine in C# geschriebene Windows-Formularanwendung zum Mischen von FASTA-formatierten Sequenzen. Die zufällige Permutation wird mithilfe einer einfachen Variation des von Durstenfeld implementierten Fisher-Yates-Algorithmus erhalten (https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%E2%80%93Yates_shuffle) (Knuth DE. Die Kunst der Computerprogrammierung: seminumerische Algorithmen. 3. Aufl. Boston: Addison-Wesley; 1997). Die Eingabedatei enthält eine oder mehrere Sequenzen im FASTA-Format. Die Anzahl der Mischvorgänge (n) für jede Sequenz kann eingestellt werden; Standardmäßig ist n 100. Die Ausgabedatei enthält n gemischte Kopien im FASTA-Format für jede Eingabesequenz.
Zum Beispiel (n=3):
Eingabedatei:
>a
ACGGT
>b
GCCCATTC
Ausgabedatei:
>a
TCGAG
>a
CGAGT
>a
TGCGA
>b
CACTCCGT
>b
CCCGTATC
>b
CCTTCAGC
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Win32 (MS-Windows)
Programmiersprache
C#
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/shufflefastaseq/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
