Dies ist die Windows-App namens Weinberg-CMfinder, deren neueste Version als cmfinder-0.4.1.18.tgz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Weinberg-CMfinder mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
Weinberg-CMfinder
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BESCHREIBUNG
Das CMfinder-Paket ist eine Reihe von Programmen mit zwei Hauptzwecken:(1) Das cmfinder-Programm leitet eine Alignment- und Consensus-Sekundärstruktur einer RNA ab, indem es nicht-alignierte Sequenzen als Eingabe verwendet.
(2) andere Werkzeuge bewerten Alignments, um Hinweise auf eine RNA-Sekundärstruktur innerhalb des Alignments anzuzeigen. RNAphylo weist einem bestehenden Alignment einen probabilistischen Score zu, wobei ein explizites phylogenetisches Modell verwendet wird. hmmpair weist eine Bewertung basierend auf dem Nachweis einer Kovariation zu, die durch die Sequenzerhaltung unterstützt wird. Das Skript ScoreMotif.pl kombiniert diese beiden Partituren zu einem.
CMfinder 0.4.1 wurde von Zasha Weinberg geschrieben, basierend auf dem CMfinder 0.3-Paket von Zizhen Yao, Infernal 1.1 von Eric Nawrocki und Sean Eddy und anderen. Die Hauptunterschiede von CMfinder 0.4.1 sind der Umgang mit abgeschnittenen metagenomischen Sequenzen, die Integration von infernal 1.1 und das hmmpair-Programm.
Weitere Informationen und Zitate finden Sie im Wiki.
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/weinberg-cmfinder/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
