Este es el comando ali2gff que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
ali2gff - Módulo para traducir archivos de salida de MUMmer a salida con formato gff.
SINOPSIS
ali2gff [-r] [-t <. | 0 | 1 | 2>] [-x ] [-y ] [-H] [-f] [-h]
OPCIONES
-h, --ayuda
Mostrar resumen de opciones.
-r Intercambie el orden de las secuencias (secuencia 1 en el eje y, secuencia 2 en el eje x).
-t <. | 0 | 1 | 2>
Ponga la etiqueta 'frame' en la salida gff.
-x
Especifique el nombre de la especie para la especie1 (predeterminado: "Seq1").
-y
Especifique el nombre de la especie para la especie2 (predeterminado: "Seq2").
-i Ignore las identidades de secuencia completa.
-f Escribe la salida en un archivo.
Utilice ali2gff en línea utilizando los servicios de onworks.net
