Este es el comando bowtie2-inspect que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
bowtie2-inspect - envoltorio para bowtie2-inspect- * index
SINOPSIS
bowtie2-inspeccionar [opciones]*
DESCRIPCIÓN
Bowtie 2 versión 2.2.6 de Ben Langmead ([email protected], www.cs.jhu.edu/~langmea)
bt2 nombre de archivo menos .1.bt2 / .2.bt2 final
De forma predeterminada, imprime registros FASTA de las secuencias de nucleótidos indexadas en
fuera. Con -n, solo imprime nombres. Con -s, solo imprime un resumen del índice
parámetros y secuencias. Con -e, conserva los colores si corresponde.
OPCIONES
- índice grande
forzar la inspección del índice "grande", incluso si hay uno "pequeño".
-a/--a través de
Número de caracteres en la salida FASTA (predeterminado: 60)
-n/ - nombres
Imprimir solo nombres de secuencia de referencia
-s/--resumen
Imprimir resumen incl. nombres de referencia, longitudes, propiedades de índice
-e/ - bt2-ref
Reconstruir la referencia de .bt2 (lento, conserva los colores)
-v/--verboso
Salida detallada (para depuración)
-h/--ayuda
imprimir una descripción detallada de la herramienta y sus opciones
--ayuda imprimir este mensaje de uso
Utilice bowtie2-inspect en línea utilizando los servicios de onworks.net
