Este es el comando bp_local_taxonomydb_queryp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
bp_local_taxonomydb_query - consulta una TaxonomyDB local para especies o taxónidos
DESCRIPCIÓN
Este script proporciona una implementación de ejemplo de acceso a una base de datos de taxonomía local.
implementado con Berkeley DB (se necesita el módulo DB_File).
Uso:
bp_local_taxonomydb_query.PLS: [-v] --nodes nodes.dmp --names names.dmp "Género1 especie1" "Género2 especies2"
Proporcionar los archivos nodes.dmp y names.dmp del volcado de taxonomía NCBI (consulte
Bio :: DB :: Taxonomy :: flatfile para obtener más información) solo es necesario la primera vez que se ejecuta.
Esto creará los índices locales y puede llevar bastante tiempo. Sin embargo, una vez creado,
Estos índices permitirán un acceso rápido de las especies a la identificación de taxón O identificación de taxón al nombre de la especie.
búsquedas.
Use bp_local_taxonomydb_queryp en línea usando los servicios de onworks.net
