Este es el comando cmtk-film que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
película: corrige el movimiento intercalado mediante interpolación inversa
SINOPSIS
película Imagen de entrada Imagen de salida
DESCRIPCIÓN
Esta herramienta divide una imagen de entrada intercalada en las imágenes de paso, las registra conjuntamente y
reconstruye una imagen con corrección de movimiento
OPCIONES
Global Herramientas De Seguros (estas están compartido by all CMTK herramientas)
--ayuda
Escriba la lista de opciones básicas de la línea de comandos en la salida estándar.
--ayudar a todo
Escriba una lista completa de opciones de línea de comandos básicas y avanzadas en la salida estándar.
--wiki
Escriba la lista de opciones de la línea de comandos en la salida estándar en el marcado de MediaWiki.
--hombre
Escriba el código fuente de la página man con el marcado 'nroff' en la salida estándar.
--xml
Escriba la especificación de la sintaxis de la línea de comandos en el marcado XML (para la integración de Slicer).
--versión
Escriba la versión del kit de herramientas en la salida estándar.
--eco
Escribe la línea de comando actual en la salida estándar.
- nivel de verbo
Establecer el nivel de verbosidad.
--verboso, -v
Incrementar el nivel de verbosidad en 1 (obsoleto; admitido por compatibilidad con versiones anteriores).
--hilos
Establezca el número máximo de subprocesos paralelos (para subprocesos POSIX y OpenMP).
Entrada De Seguros
--valor de relleno
Establecer valor de relleno para la imagen de entrada. Los píxeles con este valor se ignorarán. [Defecto:
discapacitado]
Intercalado De Seguros
- eje de intercalación
Definir eje de intercalación: esta es la dirección de corte transversal de la adquisición.
Valores admitidos: "adivinar desde la entrada", "axial", "sagital", "coronal", "interleave-x",
"interleave-y", "interleave-z", donde el valor predeterminado es "adivinar desde la entrada", o utilice uno
de los siguientes:
--conjetura a partir de la entrada
Adivina a partir de la imagen de entrada [Esta is los defecto]
--axial, -a
Imágenes de axial interleaved
--sagital, -s
Imágenes de interleaved sagittal
--coronal, -c
Imágenes de coronal interleaved
--intercalar-x, -x
Intercalado a lo largo del eje x
--intercalar-y, -y
Intercalado a lo largo del eje y
--intercalar-z, -z
Intercalado a lo largo del eje z
- pasa , -p
Número de pases intercalados [Defecto: 2]
--peso de paso , -W
Establezca el peso de contribución para un pase en la forma 'pase: peso'
Movimiento Corrección / Inscribirse De Seguros
--imagen de referencia , -R
Utilice una imagen de referencia de alta resolución separada para el registro [Defecto: NINGUNO]
--registro-metric
Métrica de registro para estimación de movimiento mediante registro de imagen a imagen. Soportado
valores: "nmi", "mi", "cr", "msd", "cc", donde el valor predeterminado es "msd", o utilice uno de los
siguientes:
--nmi
Utilice información mutua normalizada para el registro de paso a referencia
--mi Utilice información mutua estándar para el registro de paso a referencia
--cr Utilice la relación de correlación para el registro de paso a referencia
--msd
Utilice las diferencias cuadradas medias para el registro de paso a referencia [Esta is los
defecto]
--cc Utilice la correlación cruzada para el registro de paso a referencia
--import-xforms-ruta
Ruta del archivo desde el que importar transformaciones entre pasadas. [Defecto: NINGUNO]
--export-xforms-ruta
Ruta del archivo al que exportar las transformaciones entre pasadas. [Defecto: NINGUNO]
Inicial Volumen Inyección De Seguros
--inyección-kernel-sigma , -S
Desviación estándar del kernel gaussiano para inyección de volumen en múltiplos de tamaño de píxel
en cada dirección. [Defecto: 0.5]
- radio del núcleo de inyección , -r
Factor de radio de truncamiento del núcleo de inyección. El kernel está truncado en
sigma * radio, donde sigma es la desviación estándar del núcleo. [Defecto: 2]
Marcha atrás Interpolación De Seguros
- kernel de interpolación inversa
Kernel para la reconstrucción por interpolación inversa Valores admitidos: "cubic",
"linear", "hamming-sinc", "cosine-sinc", donde el valor predeterminado es "cúbico", o utilice uno de
el seguimiento:
--cúbico, -C
Interpolación tricúbica [Esta is los defecto]
--lineal, -L
Interpolación trilineal (más rápida pero menos precisa)
--hamming-SINC, -H
Interpolación sinc con ventana de Hamming
--coseno-sinc, -O
Interpolación sinc con ventana de coseno (más precisa pero más lenta)
- error de cuarto orden, -f
Utilice un error de cuarto orden (en lugar de segundo) para la optimización.
--num-iteraciones , -n
Número máximo de iteraciones de interpolación inversa [Defecto: 20]
Reconstrucción Regularización De Seguros
--l-peso-norma
Establecer el peso de la restricción para la regularización de la norma L de tipo Tikhonov (0 deshabilita la restricción)
[Defecto: 0]
- sin truncamiento, -T
Desactivar truncatrion de intensidad regional
Salida De Seguros
--escribir-imagen-inyectada
Escriba la imagen de inyección de volumen inicial en la ruta [Defecto: NINGUNO]
--escribir-imágenes-como-flotante, -F
Escribe las imágenes de salida como punto flotante [predeterminado: igual que la entrada]
AUTORES
Torsten Rohlfing, con contribuciones de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff y Yaroslav Halchenko
Utilice cmtk-film en línea utilizando los servicios de onworks.net