Este es el comando extractaligne que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
extractalign: extrae regiones de una alineación de secuencia
SINOPSIS
extraeralinear -secuencia conjunto de secuencias -regiones distancia -outseq Seqoutall
extraeralinear -ayuda
DESCRIPCIÓN
extraeralinear es un programa de línea de comandos de EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paquete de programas"). Es parte del comando "Alineación, recuperación de datos: datos de secuencia, editar"
grupo (s).
OPCIONES
Entrada .
-secuencia conjunto de secuencias
Requerido .
-regiones distancia
Regiones para extraer. Un conjunto de regiones se especifica mediante un conjunto de pares de posiciones. los
las posiciones son números enteros. Están separados por cualquier carácter no alfabético ni numérico.
Ejemplos de especificaciones regionales son: 24-45, 56-78 1:45, 67 = 99; 765..888
1,5,8,10,23,45,57,99 Valor predeterminado: $ (secuencia.begin) - $ (secuencia.end)
Salida .
-outseq Seqoutall
Utilice extractaligne en línea utilizando los servicios de onworks.net
