Este es el comando fastaq-chunker que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fastaq_chunker: divide las secuencias en trozos de igual tamaño
DESCRIPCIÓN
uso: fastaq_chunker [opciones]
Divide un archivo de varias secuencias en archivos separados. Divide las secuencias en trozos de un fijo
Talla. Apunta a fragmentos de chunk_size en cada archivo, pero permite un poco más, por lo que se puede
hasta (chunk_size + tolerancia), para evitar pequeños fragmentos hechos a partir de los extremos de las secuencias
posicional argumentos:
infile Nombre del archivo de entrada que se dividirá
out Prefijo del archivo de salida. Si - un archivo utilizado, luego el nombre del archivo de salida único
tamaño de porción
Tamaño de cada trozo
tolerancia
Tolerancia permitida en el tamaño del trozo
opcional argumentos:
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
- un archivo
Salida de todas las secuencias en un archivo
--skip_all_Ns
No genere ninguna secuencia que consista en todos los N
Utilice fastaq-chunker en línea utilizando los servicios de onworks.net
