Este es el comando fastx_trimmer que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fastx_trimmer - Recortadora FASTA / Q
DESCRIPCIÓN
uso: fastx_trimmer [-h] [-f N] [-l N] [-t N] [-m MINLEN] [-z] [-v] [-i INFILE] [-o
OUTFILE] Parte de FASTX Toolkit 0.0.14 por A. Gordon ([email protected])
[-h] = Esta útil pantalla de ayuda.
[-f N] = Primera base a mantener. El valor predeterminado es 1 (= primera base).
[-l N] = Última base para mantener. El valor predeterminado es lectura completa.
[-t N] = Recorta N nucleótidos del final de la lectura.
'-t' no se puede usar con '-l' y '-f'.
[-m MINLE]
= Con [-t], descartar lecturas más cortas que MINLEN.
[-z] = Comprimir la salida con GZIP.
[-i ARCHIVO]
= Archivo de entrada FASTA / Q. el predeterminado es STDIN.
[-o OUTFILE] = Archivo de salida FASTA / Q. el predeterminado es STDOUT.
Utilice fastx_trimmer en línea utilizando los servicios de onworks.net