Este es el comando glam2scan que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
glam2scan: encuentra un motivo GLAM2 en una base de datos
SINOPSIS
glam2scan [opciones] alfabeto mi_motivo.glam2 my_seqs.fa
Un alfabeto que no sea p or n se interpreta como el nombre de un archivo alfabético.
DESCRIPCIÓN
glam2scan encuentra coincidencias, en una base de datos de secuencia, con un motivo descubierto por glamour2. Cada
el partido recibe una puntuación, lo que indica qué tan bien encaja con el motivo.
OPCIONES (DEFECTO AJUSTES)
-h
Muestra todas las opciones y su configuración predeterminada.
-o
Archivo de salida (stdout).
-n
Número de alineaciones para informar (25).
-2
Examine ambas hebras: complemento hacia adelante y hacia atrás.
-D
Pseudocuenta de eliminación (0.1).
-E
Seudocuenta sin eliminación (2.0).
-I
Pseudocontento de inserción (0.02).
-J
Seudocuenta sin inserción (1.0).
-d
Lima de mezcla Dirichlet.
Utilice glam2scan en línea utilizando los servicios de onworks.net