mia-2dseries2sets: en línea en la nube

PROGRAMA:

NOMBRE

mia-2dseries2sets: combina imágenes de una serie en conjuntos.

SINOPSIS

mia-2dseries2sets -o [opciones]

DESCRIPCIÓN

mia-2dseries2sets Este programa toma todos los archivos de imagen que se dan como parámetros libres en
la línea de comando y crea conjuntos de segmentación basados ​​en la información que se encuentra en las imágenes.
La información utilizada es la ubicación z del corte y el número de adquisición. El codigo es
adaptado a utilizar los descriptores correspondientes definidos en el estándar DICOM. Todas las imágenes con
la misma ubicación de corte se agrupará en un conjunto de segmentación y se ordenará
según su número de adquisición. Las ubicaciones de los cortes se redondean con una precisión de tres dígitos
para hacer factible la comparación adecuada de valores de coma flotante.

OPCIONES

-o --out-directory = (salida, obligatorio); cuerda
directorio de salida (debe existir y ser escribible)

--no-copia
no copie archivos de imagen al directorio de salida

Ayuda & Info
-V --verbose = advertencia
verbosidad de la salida, imprimir mensajes de nivel dado y prioridades más altas.
Las prioridades admitidas que comienzan en el nivel más bajo son:
info - Mensajes de bajo nivel
rastrear - Seguimiento de llamadas a funciones
fallar - Informar fallas en las pruebas
advertencia - Advertencias
error - Informar errores
depurar - Salida de depuración
mensaje - Mensajes normales
fatal - Informar solo errores fatales

--derechos de autor
imprimir información de derechos de autor

-h --ayuda
imprime esta ayuda

-? --uso
imprimir una breve ayuda

--versión
imprima el número de versión y salga

Tratamiento de agua
--threads = -1
Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, este número debe ser menor
o igual al número de núcleos de procesador lógico en la máquina. (-1:
estimación automática) .Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, esto
El número debe ser menor o igual al número de núcleos de procesador lógico en
la máquina. (-1: estimación automática).

COMPLEMENTOS: 2dimage / io

bmp Soporte de entrada / salida de imagen 2D BMP

Extensiones de archivo reconocidas: .BMP, .bmp

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits sin firmar, 16 bits sin firmar

grupo de datos E / S virtual hacia y desde el grupo de datos interno

Extensiones de archivo reconocidas:. @

dicom Io de imagen 2D para DICOM

Extensiones de archivo reconocidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos admitidos:
16 bits firmados, 16 bits sin firmar

exr un complemento io de 2dimage para imágenes OpenEXR

Extensiones de archivo reconocidas: .EXR, .exr

Tipos de elementos admitidos:
32 bits sin firmar, coma flotante de 32 bits

jpg un complemento io de 2dimage para imágenes en escala de grises jpeg

Extensiones de archivo reconocidas: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Tipos de elementos admitidos:
sin firmar de 8 bits

png un complemento io de 2dimage para imágenes png

Extensiones de archivo reconocidas: .PNG, .png

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits sin firmar, 16 bits sin firmar

crudo Soporte de salida de imagen RAW 2D

Extensiones de archivo reconocidas: .RAW, .raw

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
bit

tif Soporte de entrada / salida de imagen TIFF 2D

Extensiones de archivo reconocidas: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, sin firmar de 8 bits, sin firmar de 16 bits, sin firmar de 32 bits

vista un complemento io de 2dimage para imágenes de vista

Extensiones de archivo reconocidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
bit

EJEMPLO

Cree los conjuntos de segmentación a partir de una serie de imágenes DICOM y copie los archivos en el
directorio de salida (la copia es la predeterminada).

mia-2dseries2sets -o / home / user / series /net/dicoms/patient1/series1/*.dcm

AUTOR (es)

Gert Wollny

DERECHOS DE AUTOR

Este software tiene Copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Alemania y Madrid, España. Viene
con ABSOLUTAMENTE NINGUNA GARANTÍA y puede redistribuirlo bajo los términos de GNU
LICENCIA PÚBLICA GENERAL Versión 3 (o posterior). Para obtener más información, ejecute el programa con el
opción '--copyright'.

Use mia-2dseries2sets en línea usando los servicios de onworks.net