mia-3dimagestatistics-in-mask - Online en la nube

PROGRAMA:

NOMBRE

mia-3dimagestatistics-in-mask: evalúa estadísticas dentro de una región enmascarada de la entrada
datos.

SINOPSIS

mia-3dimageestadisticas-en-mascara -i -m [opciones]

DESCRIPCIÓN

mia-3dimageestadisticas-en-mascara Este programa evalúa las estadísticas de una imagen dentro de un
región enmascarada de la imagen. Los posibles resultados son un resumen de estadísticas y un histograma de
Los valores.

OPCIONES

Archivo-IO
-i --imagen = (entrada, requerida); io
imagen de entrada a analizar Para los tipos de archivos admitidos, consulte PLUGINS: 3dimage / io

-m --mask = (entrada, obligatorio); io
imagen de máscara que se utilizará para restringir el análisis Para conocer los tipos de archivos admitidos, consulte
PLUGINS: 3dimage / io

-s --summary = (salida); cuerda
Archivo para escribir las estadísticas de resumen como texto sin formato.

-H --histograma = (salida); cuerda
Archivo para escribir el histograma

Ayuda & Info
-V --verbose = advertencia
verbosidad de la salida, imprimir mensajes de nivel dado y prioridades más altas.
Las prioridades admitidas que comienzan en el nivel más bajo son:
info - Mensajes de bajo nivel
rastrear - Seguimiento de llamadas a funciones
fallar - Informar fallas en las pruebas
advertencia - Advertencias
error - Informar errores
depurar - Salida de depuración
mensaje - Mensajes normales
fatal - Informar solo errores fatales

--derechos de autor
imprimir información de derechos de autor

-h --ayuda
imprime esta ayuda

-? --uso
imprimir una breve ayuda

--versión
imprima el número de versión y salga

parámetros
--struct-name = undefined
Nombre de la estructura para la que se evalúan las estadísticas

-l - límite = 20; uint en [20, inf)
Número de píxeles que la máscara debe contener al menos.

-b - contenedores = 8; ulong en [4, inf)
número de contenedores de histograma que se utilizarán

--hmin = 0
límite inferior para el mapeo del histograma. Todos los valores por debajo de este valor serán
mapeado en el contenedor más bajo. Si este parámetro es igual o mayor que hmax,
el rango del histograma se evalúa automáticamente Límite inferior para el histograma
cartografía. Todos los valores por debajo de este valor se asignarán al contenedor más bajo. Si
este parámetro es igual o mayor que hmax, el rango del histograma es
evaluado automáticamente.

--hmax = 0
hpper con destino al mapeo del histograma. Todos los valores por encima de este valor serán
mapeado en el contenedor más alto. Si este parámetro es igual o menor que
hmin, el rango del histograma se evalúa automáticamente.
mapeo de histograma. Todos los valores por encima de este valor se asignarán a la
contenedor más alto. Si este parámetro es igual o menor que hmin, el histograma
el rango se evalúa automáticamente.

Tratamiento de agua
--threads = -1
Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, este número debe ser menor
o igual al número de núcleos de procesador lógico en la máquina. (-1:
estimación automática) .Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, esto
El número debe ser menor o igual al número de núcleos de procesador lógico en
la máquina. (-1: estimación automática).

COMPLEMENTOS: 3dimage / io

analizar Analizar imagen 7.5

Extensiones de archivo reconocidas: .HDR, .hdr

Tipos de elementos admitidos:
8 bits sin firmar, 16 bits firmados, 32 bits firmados, coma flotante 32 bits,
coma flotante de 64 bits

grupo de datos E / S virtual hacia y desde el grupo de datos interno

Extensiones de archivo reconocidas:. @

dicom Serie de imágenes Dicom en 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos admitidos:
16 bits firmados, 16 bits sin firmar

hdf5 E / S de imagen HDF5 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .H5, .h5

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, 64 bits firmados, 64 bits sin firmar, flotantes
punto de 32 bits, punto flotante de 64 bits

inría Imagen INRIA

Extensiones de archivo reconocidas: .INR, .inr

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bit sin signo, 32 bit de coma flotante, 64 bit de coma flotante

mhd E / S de imagen MetaIO 3D utilizando la implementación VTK (experimental).

Extensiones de archivo reconocidas: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bit sin signo, 32 bit de coma flotante, 64 bit de coma flotante

ingenioso E / S de imagen 1D NIFTI-3

Extensiones de archivo reconocidas: .NII, .nii

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bits sin firmar, 64 bits firmados, 64 bits sin firmar, coma flotante 32
bit, coma flotante 64 bit

vff Formato ráster VFF Sun

Extensiones de archivo reconocidas: .VFF, .vff

Tipos de elementos admitidos:
8 bits sin firmar, 16 bits con signo

vista Vista 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
bit

vti Entrada y salida de imagen 3D VTK-XML (experimental).

Extensiones de archivo reconocidas: .VTI, .vti

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bit sin signo, 32 bit de coma flotante, 64 bit de coma flotante

vtk Entrada y salida heredada de imágenes 3D VTK (experimental).

Extensiones de archivo reconocidas: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
bit

EJEMPLO

evaluar las estadísticas resumidas en la entrada y un histograma con 10 contenedores y automáticamente
límites evaluados. Guarde el resumen en summary.txt y el histograma en hist.txt

mia-3dimagestatistics-in-mask --imagen imagen.v.gz --mask máscara.v.gz --summary resumen.txt
--histograma hist.txt

AUTOR (es)

Gert Wollny

DERECHOS DE AUTOR

Este software tiene Copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Alemania y Madrid, España. Viene
con ABSOLUTAMENTE NINGUNA GARANTÍA y puede redistribuirlo bajo los términos de GNU
LICENCIA PÚBLICA GENERAL Versión 3 (o posterior). Para obtener más información, ejecute el programa con el
opción '--copyright'.

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