Este es el comando njplot que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
njplot - Un programa de dibujo de árboles filogenéticos para biólogos newicktops - draw phylogenetic
árboles en un archivo PostScript
SINOPSIS
trama [opciones] archivo_árbol
tops nuevos [opciones] archivo_árbol
nuevoicktotxt [opciones] archivo_árbol
DESCRIPCIÓN
Esta página de manual documenta brevemente la trama mando.
Los tops nuevos El comando hace exactamente lo mismo pero no necesita pantalla X11. La salida es
procesado en un archivo PostScript.
Los nuevoicktotxt comando hace exactamente lo mismo que tops nuevos pero la salida se renderiza
en un archivo de texto.
Esta página de manual fue reescrita para la distribución Debian GNU / Linux porque el original
El programa no tiene una página de manual.
trama es un programa de dibujo de árboles capaz de dibujar cualquier árbol binario o de múltiples ramas expresado
en el formato de árbol filogenético estándar (por ejemplo, el formato utilizado por el paquete PHYLIP).
NJplot es especialmente conveniente para enraizar los árboles desarraigados obtenidos de la parsimonia,
métodos de construcción de árboles de distancia o máxima probabilidad.
Cualquier enraizamiento del árbol sin raíz se puede especificar de forma interactiva con el mouse. NJplot
también permite hacer zoom, cambiar de rama, mostrar puntajes de arranque y guardar en el
Formato PostScript. Por lo tanto, NJplot se puede utilizar como una extensión gráfica de cualquier paquete
de programa filogenético que emplea el formato de árbol estándar para almacenar árboles (es decir,
con la mayoría de estos paquetes).
OPCIONES
Solo hay las siguientes opciones que solo funcionan en un emulador de terminal x, pero no en
modo consola:
-h Imprime una breve ayuda.
-nosotros Archivo de árbol Postscript preparado para tamaño de papel Carta de EE. UU.
-opónicamente
Sin interfaz de ventana, simplemente escriba el archivo de árbol PostScript.
-Talla n
El tamaño de fuente n se usa para los nombres de taxón.
-ordenador personal n número de páginas para salida PostScript.
tamaño alto x ancho
tamaño de la página PostScript expresado como WIDTHxHEIGHT.
-longitudes
Muestra las longitudes de las ramas si aparecen en el archivo de árbol.
-bota Muestre los valores de bootstrap si aparecen en el archivo de árbol.
-Sin título
No incluya el título en la salida PostScript.
Use njplot en línea usando los servicios de onworks.net
