Este es el comando nps2gps que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
nps2gps: convierte conjuntos de proteínas de nucleótidos en conjuntos de productos genómicos ASN.1
SINOPSIS
nps2gps [-] [-D] [-F] [-G str] [-L] [-N] [-P] [-Q] [-R] [-T] [-U] [-f str] [-i nombre de archivo]
[-o nombre de archivo] [-p camino] [-r camino] [-x str]
DESCRIPCIÓN
nps2gps convierte los conjuntos de NCBI Bioseq de conjuntos simples de nucleótidos-proteínas a conjuntos genómicos completos
conjuntos de productos completos con transcripciones de ARNm, que genera como texto ASN.1.
OPCIONES
Un resumen de las opciones se incluye a continuación.
- Mensaje de uso de impresión
-D Títulos de ARNm de RefSeq
-F Asignar por ID de función
-G str Nombre de la base de datos de ID general
-L Bloquear componentes por adelantado
-N Promover ARN no codificantes
-P ID de ARNm de proteína
-Q Títulos especiales de ARNm
-R Habilitar la recuperación remota desde la identificación
-T Mapa por ID de transcripción
-U Eliminar referencias cruzadas de genes innecesarias
-f str Filtro de subcadena
-i nombre de archivo
Archivo de entrada única (predeterminado = stdin)
-o nombre de archivo
Archivo de salida único (predeterminado = stdout)
-p camino
Ruta de los archivos para la conversión por lotes
-r camino
Ruta de los resultados de la conversión por lotes
-x str Sufijo de selección de archivos para conversión por lotes (predeterminado = .ent)
Use nps2gps en línea usando los servicios de onworks.net