Este es el obconformer de comandos que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
obconformador - generar coordenadas conformer
SINOPSIS
obconformador # of conformadores # of de optimización pasos nombre de archivo
DESCRIPCIÓN
La herramienta obconformer se puede utilizar como parte de un estudio conformacional mediante la generación aleatoria
conformadores usando una búsqueda de Monte Carlo. El mejor conformador del lote de conformadores
se generará, después de realizar el número proporcionado de pasos de optimización de geometría. Por defecto,
obconformer utiliza el campo de fuerza MMFF94.
EJEMPLOS
obconformer 250 baseconformer.sdf> rotamer100.sdf
Genere el mejor conformador (de 250) de baseconformer.sdf y escríbalo en rotamer1.sdf
después de 100 pasos de optimización de geometría
Utilice obconformer en línea utilizando los servicios de onworks.net
