Este es el comando prophecye que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
profecía: cree una matriz de frecuencia o un perfil a partir de una alineación múltiple
SINOPSIS
profecía -secuencia conjunto de secuencias Tipo lista -archivo de datos matrizf -nombre cadena -umbral entero
-abierto flotar -extensión flotar -archivo de salida archivar
profecía -ayuda
DESCRIPCIÓN
profecía es un programa de línea de comandos de EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paquete de programas"). Es parte del (los) grupo (s) de comando "Nucleic: Perfiles, Proteína: Perfiles".
OPCIONES
Entrada .
-secuencia conjunto de secuencias
Tipo lista
Valor predeterminado: F
-archivo de datos matrizf
Valor predeterminado: @ ($ (tipo) = G: Epprofile H: EBLOSUM62 F: EBLOSUM62)
Requerido .
-nombre cadena
Valor predeterminado: mymatrix
Mi Perfil tipo soluciones y opciones
-umbral entero
Valor predeterminado: 75
Gap opciones
-abierto flotar
Valor predeterminado: 3.0
-extensión flotar
Valor predeterminado: 0.3
Salida .
-archivo de salida archivar
Utilice Profecye en línea utilizando los servicios de onworks.net
