Este es el comando pyFAI-calib que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
pyFAI-calib - herramienta de calibración
DESCRIPCIÓN
uso: pyFAI-calib [opciones] -w 1 -D detector -c calibrante.D archivo de imagen.edf
Calibre la geometría de configuración de difracción basada en imágenes de anillos de Debye-Sherrer sin
conocimiento a priori de su configuración. Deberá proporcionar un calibrante o un archivo "d-spacing"
que contiene el espaciado de los planos de Miller en Angstrom (en orden decreciente). Calibrantes
disponibles: Ni, CrOx, NaCl, Si_SRM640e, Si_SRM640d, Si_SRM640a, Si_SRM640c, Si_SRM640b,
Cr2O3, AgBh, Si_SRM640, CuO, PBBA, alpha_Al2O3, cuarzo, C14H30O, cristobaltita, Si, LaB6,
CeO2, LaB6_SRM660a, LaB6_SRM660b, LaB6_SRM660c, TiO2, ZnO, Al, Au o busque en el
Base de datos de mineralogistas estadounidenses: http://rruff.geo.arizona.edu/AMS/amcsd.php El sistema --calibrante
¡La opción es obligatoria!
posicional argumentos:
ARCHIVO Lista de archivos para calibrar
opcional argumentos:
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
-V, --versión
mostrar el número de versión del programa y salir
-o EXPEDIENTE, --fuera ARCHIVO
Nombre de archivo donde se guarda la imagen procesada
-v, --verboso
cambiar al modo de depuración / detallado
-c EXPEDIENTE, --calibrante ARCHIVO
Nombre del calibrante o archivo que contiene el espaciado d de la muestra de referencia (OBLIGATORIO,
distingue mayúsculas y minúsculas !)
-w LONGITUD DE ONDA, --longitud de onda LONGITUD DE ONDA
longitud de onda del haz de rayos X en Angstrom. Obligatorio
-e ENERGÍA, --energía ENERGIA
energía del haz de rayos X en keV (hc = 12.398419292keV.A).
-P POLARIZACIÓN_FACTOR, --polarización POLARIZACIÓN_FACTOR
factor de polarización, desde -1 (vertical) a +1 (horizontal), el valor predeterminado es Ninguno (no
corrección), los sincrotrones rondan el 0.95
-i EXPEDIENTE, --poni ARCHIVO
archivo que contiene el parámetro de difracción (archivo poni). OBLIGATORIO para
pyFAI-recalib!
-b ANTECEDENTES, --antecedentes ANTECEDENTES
Resta automática de fondo si no se proporciona ningún valor
-d OSCURO, --oscuro OSCURO
lista de imágenes oscuras separadas por comas para promediar y restar
-f PLANO, --plano Ω FLAT - Soporte de barras plano
lista de imágenes planas separadas por comas para promediar y dividir
-s RANURA, --ranura RANURA
archivo spline que describe la distorsión del detector
-D DETECTOR_NOMBRE, --detector DETECTOR_NOMBRE
Nombre del detector (en lugar de tamaño de píxel + spline)
-m MÁSCARA, --máscara MÁSCARA
archivo que contiene la máscara (para reconstrucción de imágenes)
-n TNP, --pt NPT
archivo con puntos de datos guardados. Predeterminado: basename.npt
--filtrar FILTRO
seleccione el filtro, ya sea media (predeterminado), máximo o mediano
-l DISTANCIA, --distancia DISTANCIA
distancia muestra-detector en milímetros. Por defecto: 100 mm
--distrito DIST.
distancia muestra-detector en metros. Predeterminado: 0.1 m
--poni1 PONI1
poni1 coordenada en metros. Predeterminado: centro del detector
--poni2 PONI2
poni2 coordenada en metros. Predeterminado: centro del detector
--rot1 ROT1
rot1 en radianes. predeterminado: 0
--rot2 ROT2
rot2 en radianes. predeterminado: 0
--rot3 ROT3
rot3 en radianes. predeterminado: 0
--arreglar-dist
arreglar el parámetro de distancia
--dist-libre
Libere el parámetro de distancia. Predeterminado: activado
--arreglar-poni1
arreglar el parámetro poni1
--free-poni1
libera el parámetro poni1. Predeterminado: activado
--arreglar-poni2
arreglar el parámetro poni2
--free-poni2
libera el parámetro poni2. Predeterminado: activado
--fix-rot1
arreglar el parámetro rot1
--free-rot1
libera el parámetro rot1. Predeterminado: activado
--fix-rot2
arreglar el parámetro rot2
--free-rot2
libera el parámetro rot2. Predeterminado: activado
--fix-rot3
arreglar el parámetro rot3
--free-rot3
libera el parámetro rot3. Predeterminado: activado
- longitud de onda fija
Corrija el parámetro de longitud de onda. Predeterminado: activado
- longitud de onda libre
Libere el parámetro de longitud de onda. Predeterminado: desactivado
--inclinación Permita que la inclinación inicial del detector se refine (rot1, rot2, rot3). Predeterminado: activado
- sin inclinación
Se desactivó el refinamiento de la inclinación y se estableció toda la rotación en 0
--saturación SATURACIÓN
considerar todos los píxeles> máx. * (saturación 1) como saturados y reconstruirlos, predeterminado: 0
(desactivado)
--ponderado
peso ajustado por intensidad, por defecto no.
--npt NPT_1D
Número de puntos en patrón integrado 1D, predeterminado: 1024
--npt-azim NPT_2D_AZIM
Número de sectores azimutales en imágenes integradas 2D. Predeterminado: 360
--npt-rad NPT_2D_RAD
Número de contenedores radiales en imágenes integradas 2D. Por defecto: 400
--unidad UNIDAD
Unidades válidas para rango radial: 2th_deg, 2th_rad, q_nm ^ -1, q_A ^ -1, r_mm. Defecto:
2º_grado
--no-GUI
obligar al programa a ejecutarse sin una interfaz gráfica
--no interactivo
forzar la ejecución del programa y salir sin solicitar mejoras
-r, --reconstruir
Reconstruir la imagen donde los datos están enmascarados o <0 (para detectores o detectores Pilatus
con módulos)
-g gaussiano, --gaussiano GAUSSIANO
Tamaño del kernel gaussiano. Tamaño del espacio (en píxeles) entre dos
anillos, por defecto 100 Incrementar el valor si el arco no está completo; disminuir el
valor si los arcos se mezclan.
--cuadrado
Utilice la forma de núcleo cuadrado para la búsqueda de vecinos en lugar de la forma de diamante
-p PÍXEL, --píxel PIXEL
tamaño del píxel en micras
La salida de este programa es un archivo "PONI" que contiene la descripción del detector y los 6
parámetros refinados (distancia, centro, rotación) y longitud de onda. Una difracción 1D y 2D
también se producen patrones. (archivos .dat y .azim)
Utilice pyFAI-calib en línea utilizando los servicios de onworks.net