Esta es la reparación de comandos que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
reparación: un componente de la suite subread
USO
reparación [opciones] -i -o
Argumentos requeridos:
-i
Nombre del archivo de entrada. Formato BAM por defecto.
-o
Nombre del archivo de salida. El archivo de salida está en formato BAM.
Argumentos opcionales:
-S El archivo de entrada está en formato SAM.
-c Comprima el archivo BAM de salida. Esto reducirá el tamaño del archivo BAM, pero
aumentar el tiempo de recuperación de lecturas del archivo BAM.
-T
Número de subprocesos de la CPU. 8 por defecto.
-d No agregue lecturas ficticias para lecturas singleton.
-t No incluya secuencias y puntuaciones de calidad de las lecturas en el archivo de salida.
Utilice la reparación en línea utilizando los servicios de onworks.net
