Este es el comando trna2sap que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
trna2sap: convierte la salida de tRNAscan-SE en un objeto ASN.1 Seq-annot
SINOPSIS
trna2sap [-] [-a] [-c str] [-f str] [-i nombre de archivo] [-j] [-m str] [-n str] [-o nombre de archivo]
[-p dir] [-r dir] [-s] [-t str] [-u] [-x str]
DESCRIPCIÓN
trna2sap lee un archivo de texto producido por tRNAscan-SE y produce un ASN.1 Seq-
anotar en el formato entendido por otras herramientas NCBI.
OPCIONES
Un resumen de las opciones se incluye a continuación.
- Mensaje de uso de impresión
-a Agregar cita de tRNAscan-SE
-c str Comentario
-f str Filtro de subcadena
-i nombre de archivo
Archivo de entrada única (entrada estándar por defecto)
-j Simplemente produzca una tabla de características de cinco columnas, a la trna2tbl(1).
-m str Observación
-n str Nombre de la anotación (normalmente "tRNA").
-o nombre de archivo
Archivo de salida única (salida estándar por defecto)
-p dir Ruta a los archivos
-r dir Ruta de resultados
-s Ignorar los pseudo ARNt
-t str Título de la anotación (normalmente “tRNAscan-SE”).
-u Ignorar ARNt indeterminados
-x str Sufijo de selección de archivo con -p (.trna por defecto).
Utilice trna2sap en línea utilizando los servicios de onworks.net
