Este es el comando xtractore que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
xtractore: extrae secuencias correspondientes a características anotadas de la secuencia dada
presentar
SINOPSIS
extractor [opciones] caracteristicas.gff3 Secuencias.fasta
DESCRIPCIÓN
Opciones:
-d| --debug
imprimir salida de depuración
-h| --ayuda
imprime este mensaje de ayuda y sal
-i| --idfile: ARCHIVO
archivo que contiene una lista de ID de funciones (1 por línea sin espacios); si se proporciona,
solo se extraerán las características con ID en este archivo
-o| --outfile: ARCHIVO
archivo en el que se escribirán las secuencias de salida; el predeterminado es terminal (stdout)
-t| --tipo: STRING
tipo de característica para extraer; se puede utilizar varias veces para extraer características de múltiples
tipos
-v| --versión
imprimir el número de versión y salir
-V| --verbose
imprimir mensajes de error y advertencia detallados
-w| --ancho: INT
ancho de cada línea de secuencia en la salida Fasta; el predeterminado es 80; establecer en 0 para no
formato
Use xtractore en línea usando los servicios de onworks.net
