Esta es la aplicación de Linux llamada KVFinder cuya última versión se puede descargar como KVFinder_linux_distribution.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada KVFinder con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Buscador de KV
DESCRIPCIÓN
La caracterización de los sitios de unión a proteínas es un desafío importante en biología computacional. Las proteínas interactúan con una amplia variedad de moléculas y la comprensión de estas complejas interacciones es esencial para obtener un conocimiento más profundo de la función de las proteínas. Se sabe que la complementariedad de formas es importante para determinar las interacciones proteína-ligando. Además, se ha demostrado que estas características estructurales de las proteínas son útiles para ayudar a los químicos medicinales durante el descubrimiento y la optimización de los prospectos. Desarrollamos KVFinder, una herramienta muy versátil y fácil de usar para la prospección de cavidades y la caracterización espacial. KVFinder es un método basado en geometría que tiene una personalización innovadora del espacio de búsqueda. Esta característica brinda la posibilidad de segmentación de la cavidad, que junto con el gran conjunto de parámetros personalizables, permite análisis detallados de la cavidad. KVFinder también es fácil de usar, ya que está disponible como complemento de PyMOL o como versión de línea de comandos.Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/kvfinder/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.