Esta es la aplicación de Linux llamada MaxBin2 cuya última versión se puede descargar como MaxBin-2.2.7.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MaxBin2 con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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MaxBin2
DESCRIPCIÓN
MaxBin2 es la próxima generación de MaxBin (https://sourceforge.net/projects/maxbin/) que admite varias muestras al mismo tiempo. MaxBin es un software para agrupar secuencias metagenómicas ensambladas basado en un algoritmo de maximización de expectativas. Los usuarios podrían comprender los contenedores subyacentes (genomas) de los microbios en sus metagenomas simplemente proporcionando secuencias metagenómicas ensambladas y la información de cobertura de lecturas o lecturas de secuenciación. Para comodidad de los usuarios, MaxBin informará las estadísticas relacionadas con el genoma, incluida la completitud estimada, el contenido de GC y el tamaño del genoma en la página de resumen de agrupamiento. Los usuarios pueden usar MEGAN o un software similar en los contenedores MaxBin para averiguar la taxonomía de cada contenedor una vez finalizado el proceso de clasificación.Puede encontrar más información en el sitio web oficial de MaxBin: http://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html
Caracteristicas
- Binning de metagenómica
Lenguaje de programación
C + +
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/maxbin2/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.