Esta es la aplicación de Linux llamada AmpliMethProfiler cuya última versión se puede descargar como AmpliMethProfiler_1.2.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada AmpliMethProfiler con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
AmpliMethProfiler
DESCRIPCIÓN:
La herramienta ampliMethProfiler proporciona una forma fácil y fácil de usar para extraer y analizar la composición de epihaplotipos de lecturas de experimentos de secuenciación de bisulfitos específicos.Específicamente, ampliMethProfiler proporciona una manera fácil y amigable para el usuario de extraer y analizar la composición epialélica de lecturas de experimentos de secuenciación de bisulfito específicos. ampliMethProfiler está escrito en lenguaje Python y requiere una instalación local de las herramientas BLAST y QIIME. Se puede ejecutar en plataformas Linux y OS X.
CÓMO CITARNOS:
"ampliMethProfiler: una tubería para el análisis de perfiles de metilación de CpG de amplicones secuenciados de bisulfito profundo dirigido". Scala G. y col. BMC Bioinformatics (2016) 17: 484,
DOI: 10.1186/s12859-016-1380-3
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/amplimethprofiler/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.