Esta es la aplicación de Linux llamada BiomeNet para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como BiomeNet.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada BiomeNet para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
BiomeNet para ejecutar en Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
La metagenómica produce una enorme cantidad de secuencias microbianas a las que se les puede asignar una función metabólica. El uso de estos datos para inferir la divergencia metabólica a nivel de la comunidad se ve obstaculizado por la falta de un marco estadístico adecuado. Aquí, describimos un nuevo modelo bayesiano jerárquico, llamado BiomeNet (inferencia bayesiana de redes metabólicas), para inferir la prevalencia diferencial de redes metabólicas entre comunidades microbianas. Para inferir la estructura de las interacciones metabólicas a nivel de la comunidad, BiomeNet aplica un marco de modelado de membresía mixta a la información de abundancia de enzimas. La idea básica es que los componentes de la mezcla del modelo (reacciones metabólicas, subredes y redes) se comparten entre todos los grupos (muestras de microbioma), pero las proporciones de la mezcla varían de un grupo a otro. A través de este marco, el modelo puede capturar estructuras anidadas dentro de los datos. BiomeNet es único en el modelado de cada muestra de metagenoma como una mezcla de sistemas metabólicos complejos (metabosistemas).Audiencia
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
C ++, S / R
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/biomenet/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
