Esta es la aplicación de Linux llamada bspipe cuya última versión se puede descargar como bspipe-1.3.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada bspipe con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
tubo bs
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DESCRIPCIÓN
BSpipe es una tubería integral desde el control de calidad de la secuencia y el mapeo hasta el análisis funcional de regiones metiladas diferencialmente:
(1) evaluación de la calidad de la secuenciación,
(2) secuencia de limpieza,
(3) mapeo de lectura de secuencia,
(4) cuantificación de metilación,
(4) comparaciones de muestras basadas en el perfil de metilación,
(5) identificación de DMR (regiones metiladas diferencialmente),
(6) anotación de DMR,
(7) análisis funcional de genes metilados diferencialmente,
(8) generación de archivos de entrada para visualización, y
(9) compatibilidad con tecnologías de secuenciación avanzadas como TAB-seq, OxBS-seq, MAP-it y NOMe-seq.
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Unix Shell, Perl, S / R
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/bspipe/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
