Esta es la aplicación de Linux llamada ConoSorter cuya última versión se puede descargar como ConoSorter_v1.1.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada ConoSorter con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
ConoSorter
DESCRIPCIÓN:
ConoSorter es un programa independiente de alto rendimiento que implementa expresiones regulares y modelos de perfil ocultos de Markov (pHMM) para la identificación y clasificación a gran escala de conopéptidos precursores en superfamilias y clases de genes basados en la señal de ER, regiones pro y conopéptidos maduros generados a partir de datos transcriptómicos o proteómicos sin procesar de próxima generación.
ConoSorter también genera un conjunto de información adicional relevante (frecuencia de secuencias de proteínas, longitud, número de residuos de cisteína, tasa de hidrofobicidad de la región N-terminal) y busca automáticamente la base de datos de ConoServer para permitir al usuario evaluar la confiabilidad y relevancia de los resultados y para ayudar a la identificación de nuevas superfamilias y clases de conopéptidos.
Caracteristicas
- Actualización de ConoSorter_v1.1 (2013-11-06): Nuevas superfamilias (V. Lavergne et al., BMC Genomics - 2013; AH. Jin et al., MCP - 2013) y Clase (C. Moeller et al., JBC - 2010).
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/conosorter/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.