Esta es la aplicación de Linux llamada CRISPR-Offinder cuya última versión se puede descargar como CRISPR-offinder-1.0.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada CRISPR-Offinder con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
Ofender CRISPR
DESCRIPCIÓN:
Resumen: Diseñar ARN de guía pequeña CRISPR específicos y eficientes (sgRNA) es una de las claves para una aplicación exitosa de la tecnología CRISPR. Es importante destacar que se han descubierto cada vez más endonucleasas guiadas por ARN con diferentes motivos adyacentes al protoespaciador (PAM). Por lo tanto, existe una necesidad urgente de desarrollar una herramienta versátil para diseñar sgRNA para satisfacer el requisito de diferentes endonucleasas de ADN guiadas por ARN. Con este fin, se desarrolló un programa de diseño de sgRNA flexible llamado “CRISPR-offinder”. La característica más importante de este nuevo programa es que admite todos los tipos de PAM conocidos, así como el PAM definido por el cliente. Además, CRISPR-offinder puede encontrar y clasificar los sgRNA candidatos en el genoma por número de sitios fuera del objetivo, y también se puede usar para diseñar gRNAs únicos o pareados. CRISPR-offinder está disponible gratuitamente como un programa de línea de comandos o accesible a través de nuestro sitio web.
Disponibilidad: CRISPR-offinder está disponible gratuitamente en http://crispr-offinder.com/ or http://crispr.igenetech.com/.
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/crispr-offinder/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.