Esta es la aplicación de Linux llamada Drug Extraction para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como DrugExtractionStandalone.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Drug Extraction para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
Extracción de fármacos para ejecutar en Linux en línea
DESCRIPCIÓN:
Reconocimiento y normalización / conexión a tierra de nombres de medicamentos a identificaciones y nombres estándar de DrugBank.El paquete proporciona 2 etiquetadores:
1. DrugTagger: basado en CRF con función de presencia de DrugBank (consulte el conjunto de funciones para obtener más detalles).
2. DrugnameGazetteer - nomenclátor / basado en diccionario. Diccionario creado a partir de la base de datos DrugBank.ca.
Ambos etiquetadores incluyen conexión a tierra / normalización a identificaciones de DrugBank y nombres estándar.
Conjunto de características:
Word, Word-1, Word + 1, Word-1_Word, Word_Word + 1, DrugBankPresence, POS
La función DrugBankPresence indica la presencia del nombre del fármaco en el DrugBank.
Usando CONLL-Evaluation:
procesó 32065 tokens con 3656 frases; encontrado: 3251 frases; correcto: 2786.
precisión: 95.25%; precisión: 85.70%; recuerdo: 76.20%; FB1: 80.67
Usando GATE Corpus Benchmark:
Estricto: P: 0.65 R: 0.73 F1: 0.69
Indulgente: P: 0.74 R: 0.84 F1: 0.78
Los detalles sobre cómo reproducir la evaluación, consulte README.
Para usar la versión independiente para etiquetar, descargue DrugExtractionStandalone.tar.gz de Archivos.
Interfaz de usuario
Consola / Terminal
Lenguaje de programación
Java
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/drug-extraction/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.