Esta es la aplicación de Linux llamada FastQC cuya última versión se puede descargar como v0.12.1sourcecode.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada FastQC con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Control de calidad rápido
DESCRIPCIÓN
FastQC es una herramienta de análisis de control de calidad diseñada para detectar problemas potenciales en conjuntos de datos de secuenciación de alto rendimiento. Su objetivo es proporcionar una forma sencilla de verificar la calidad de los datos de secuencia sin procesar que provienen de procesos de secuenciación de alto rendimiento. Lo hace ejecutando un conjunto modular de análisis en uno o más archivos de secuencia sin procesar en formato fastq o bam. Luego produce un informe que resume los resultados y destaca las áreas en las que la biblioteca puede parecer inusual. Esto debería indicarle dónde sus datos pueden tener problemas y permitirle tomar las medidas necesarias para corregirlos antes de realizar más análisis.
FastQC no está vinculado a ningún tipo específico de técnica de secuenciación, por lo que se puede usar para buscar bibliotecas de varios tipos de experimentos (secuenciación genómica, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq, etc.).
Caracteristicas
- Importa datos de archivos BAM, SAM o FastQ
- Ofrece una descripción general rápida que destaca las áreas problemáticas potenciales
- Gráficos y tablas de resumen para una evaluación rápida de los datos
- Exportar resultados a HTML
- Se puede utilizar sin conexión
Lenguaje de programación
Java
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener desde https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
