Esta es la aplicación de Linux llamada FASTQSim cuya última versión se puede descargar como FASTQsim_v2.0.tgz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada FASTQSim con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
FASTQ Sim
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DESCRIPCIÓN
FASTQSim es una herramienta que proporciona la doble funcionalidad de caracterización de conjuntos de datos de secuenciación de próxima generación y generación de datos metagenómicos.
FASTQSim es independiente de la plataforma de secuenciación y calcula distribuciones de longitud de lectura, puntuaciones de calidad, tasas de indel, tasas de mutación de un solo punto, tamaño de indel y estadísticas similares para cualquier secuenciación
plataforma. Para crear conjuntos de datos de entrenamiento o prueba, FASTQSim tiene la capacidad de convertir secuencias de destino en lecturas in silico con coincidencias
perfiles de error.
FASTQsim permite al usuario simular conjuntos de datos de lectura individuales que se pueden utilizar como escenarios de prueba estandarizados para planificar proyectos de secuenciación o para realizar evaluaciones comparativas de software metagenómico. En este sentido, los conjuntos de datos in silico generados con la herramienta FASTQsim tienen varias ventajas sobre los conjuntos de datos naturales: son independientes de la plataforma de secuenciación, están extremadamente bien caracterizados y son menos costosos de generar.
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/fastqsim/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
