Esta es la aplicación de Linux llamada FPF cuya última versión se puede descargar como FPF_Linux.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada FPF con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
FPF
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DESCRIPCIÓN
La cuantificación relativa de marcado isobárico es una de las tecnologías de cuantificación proteómica dominantes. Las canalizaciones de cuantificación tradicionales para datos de MS marcados con isobáricos se basan en la búsqueda de bases de datos de secuencias. Presentamos una nueva tubería de cuantificación que integra la búsqueda en la base de datos de secuencias, la búsqueda en la biblioteca espectral y un filtro (FPF) basado en características de coincidencia de espectro de péptidos (PSM) que utiliza varias características espectrales para el filtrado. La búsqueda combinada en la base de datos y la biblioteca espectral da como resultado una mayor cobertura de cuantificación, y el filtro elimina los PSM con mayor error de cuantificación, conservando los de mayor precisión de cuantificación. El oleoducto propuesto es totalmente compatible con el oleoducto transproteómico y se puede ejecutar en plataformas Windows, Linux y MacOS.
Caracteristicas
- proteómica
- cuantificación de marcado isobárico
- búsqueda de biblioteca espectral
Esta es una aplicación que también se puede obtener desde https://sourceforge.net/projects/comics-fpf/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
