Esta es la aplicación de Linux llamada HomSI cuya última versión se puede descargar como HomSI.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada HomSI con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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homsi
DESCRIPCIÓN
En familias consanguíneas, como resultado de heredar los mismos segmentos genómicos a través de ambos padres, los individuos tienen tramos de sus genomas que son homocigotos. Esta situación conduce a la prevalencia de enfermedades recesivas entre los miembros de estas familias. El mapeo de homocigosidad se basa en esta observación y, con la ayuda de esta técnica, se han descubierto varios genes de enfermedades recesivas en familias consanguíneas. Los investigadores suelen utilizar matrices de SNP para determinar las regiones homocigotas y luego buscar el gen de la enfermedad mediante la secuenciación de los genes dentro de este loci de enfermedad candidato. Recientemente, el advenimiento de la secuenciación de próxima generación permite la identificación concurrente de regiones homocigotas y la detección de mutaciones relevantes para el diagnóstico, utilizando datos de un único experimento de secuenciación. En este sentido, hemos desarrollado una nueva herramienta que identifica regiones homocigotas utilizando datos de secuencia profunda. Usando archivos * .vcf como archivo de entrada, nuestro programa identifica el majo
Caracteristicas
- Mapeo de homocigosidad en datos NGS
Interfaz de usuario
SWT de Java
Lenguaje de programación
Java
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/homsi/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
