Esta es la aplicación de Linux llamada mCarts cuya última versión se puede descargar como mCarts.v1.2.0.tgz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada mCarts con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
mCarts
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DESCRIPCIÓN
Muchas RBP reconocen secuencias muy cortas y degeneradas, y la especificidad de la focalización se logra mediante mecanismos como la unión sinérgica a múltiples sitios agrupados y la modulación de la accesibilidad del sitio a través de diferentes estructuras secundarias de ARN. mCarts integra el número y el espaciado de los sitios de motivos individuales, su accesibilidad y conservación, lo que mejora sustancialmente la relación señal / ruido. Este algoritmo aprende y cuantifica las reglas de estas características, aprovechando una gran cantidad de sitios de unión de RBP in vivo obtenidos de la secuenciación de alto rendimiento de ARN aislados por reticulación e inmunoprecipitación (HITS-CLIP). Aplicamos este algoritmo para estudiar dos RBP representativas, Nova y Mbnl. A pesar del contenido muy bajo de información en los elementos de motivo individuales, nuestro algoritmo hizo predicciones muy específicas para una validación experimental exitosa.
Audiencia
Ciencia / Investigación, Usuarios finales avanzados
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Perl
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/mcarts/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
