Esta es la aplicación de Linux llamada MPprimer para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como MPprimer-1.5-macOS-64.tar.bz2. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MPprimer para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
MPprimer para ejecutar en Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
Antecedentes: La PCR multiplex, definida como la amplificación simultánea de múltiples regiones de una plantilla de ADN utilizando más de un conjunto de cebadores (que comprende un cebador directo y un cebador inverso) en un tubo, se ha utilizado ampliamente en estudios de microbiología clínica y ambiental. Sin embargo, el diseño de cebadores para PCR multiplex sigue siendo un problema desafiante y es necesario considerar varios factores. Estos problemas incluyen cebado incorrecto debido a la unión inespecífica a moldes de ADN no diana, dimerización del cebador y la incapacidad para separar y purificar amplicones de ADN de movilidad electroforética similar.Resultados: Se desarrolló un nuevo programa llamado MPprimer para ayudar a los usuarios a diseñar conjuntos de cebadores para PCR multiplex con alta confiabilidad. Emplea el programa de diseño de cebadores Primer3 y el programa de evaluación de especificidad de cebadores MFEprimer para diseñar y evaluar los cebadores candidatos basados en una base de datos de ADN genómico o transcrito, seguido de un examen cuidadoso para evitar la dimerización del cebador.
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/mpprimer/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.