Esta es la aplicación de Linux llamada ParDRe cuya última versión se puede descargar como ParDRe-rel2.2.5.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada ParDRe con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
ParDRe
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DESCRIPCIÓN
ParDRe es una herramienta paralela para eliminar lecturas duplicadas. Las lecturas duplicadas pueden verse como idénticas
o secuencias casi idénticas con algunos desajustes. Esta herramienta permitirá a los usuarios evitar el análisis de lecturas innecesarias, reduciendo el tiempo de procedimientos posteriores con el conjunto de datos (por ejemplo, ensamblajes, mapeos, etc.).
La herramienta se implementa con MPI para explotar las capacidades paralelas de multinúcleo
racimos. Es más rápido que sus homólogos multiproceso (finales de 2015) para el mismo número de núcleos y, gracias a la tecnología de paso de mensajes, se puede ejecutar en clústeres.
También existe una contraparte de MapReduce de ParDRe, llamada MarDRe (vea el enlace de arriba).
ACTUALIZACIÓN: Desde la versión 2.0.5, ParDRe también proporciona soporte para eliminar solo duplicados ópticos (y dejar duplicados biológicamente interesantes), así como para trabajar con entrada / salida comprimida con formato .gz.
Audiencia
Tecnología de la información, Industria de la salud, Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Consola / Terminal, línea de comandos
Lenguaje de programación
C + +
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/pardre/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
