Esta es la aplicación de Linux llamada PPSeq: Parallel NGS Analysis para ejecutar en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada PPSeq: Parallel NGS Analysis para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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PPSeq: análisis paralelo de NGS para ejecutar en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
La tecnología de secuenciación de próxima generación (NGS) de alto rendimiento ha surgido rápidamente como una herramienta poderosa en muchos aspectos de la investigación biomédica. Sin embargo, junto con su rápido desarrollo, la magnitud de los datos y la complejidad del análisis para NGS superan con creces la capacidad y la capacidad de las instalaciones informáticas tradicionales a pequeña escala, como los algoritmos de subprocesos múltiples en estaciones de trabajo independientes. Para abordar este problema, aquí presentamos una solución que utiliza el suministro cada vez mayor de potencia de procesamiento mediante sistemas de procesamiento paralelo masivo (MPP).Caracteristicas
- ppalgn: alineación de lecturas de secuenciación con secuencias de referencia largas
- ppbwt: construcción de un índice FM a partir de un conjunto de secuencias de ADN
Audiencia
Educación, ingeniería, industria de la salud, tecnología de la información, organizaciones sin fines de lucro, ciencia / investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
C + +
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/ppseq/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
