Esta es la aplicación de Linux llamada RNAseqR cuya última versión se puede descargar como RNAseqR_1.1.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada RNAseqR con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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ARNseqR
DESCRIPCIÓN
RNAseqR está diseñado para el análisis de expresión de datos de RNA-seq y es más adecuado para el análisis de múltiples bibliotecas no replicadas. Es un programa codificado en C ++ compilado actualmente para sistemas Linux.
Con GUI y interfaces de línea de comando, puede realizar transformaciones log, PPM y / o RPKM (si se proporcionan longitudes), así como análisis estadístico para expresión diferencial, utilizando la función de distribución acumulativa binomial negativa (CDF) o la estadística de prueba R introducido para el análisis EST por Stekel, et al.
La salida permite decisiones basadas en probabilidades CDF, valores R superiores o comparación de valores R con datos aleatorios. Las comparaciones son la métrica de credibilidad de Stekel et al, o la R observada frente a la esperada en una expresión media dada. La aleatorización se realiza a través de distribuciones binomiales negativas o de Poisson, o barajado de columnas.
Lenguaje de programación
C + +
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/rnaseqr/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
