Esta es la aplicación de Linux llamada TVscript cuya última versión se puede descargar como tvscript.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada TVscript con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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guión de televisión
DESCRIPCIÓN
TVscript es una herramienta diseñada para permitir al usuario explorar la eliminación de transcripciones asociadas con la variación del recuento de lecturas dentro de la condición que es mayor que un umbral especificado por el usuario. Se produce un conjunto de archivos de recuento actualizados a partir de los datos de entrada originales en los que no se encuentran dichas transcripciones. Estos archivos de recuento actualizados se pueden utilizar posteriormente en análisis posteriores, por ejemplo, en la identificación de transcripciones expresadas diferencialmente. En este último, el grado de variación intra-condición afecta las listas finales de genes identificados de manera ambigua e inconsistente, a través de diferentes software diseñados para esta tarea. Ser capaz de explorar los efectos de eliminar dicha variación en distintos umbrales aumenta la percepción intuitiva en relación tanto con el análisis de expresión diferencial como con otras áreas de investigación que utilizan dichos datos. Los detalles completos y dos estudios de caso que involucran datos transcriptómicos asociados con la domesticación de cánidos están disponibles en nuestro artículo: enlace disponible en breve.
Caracteristicas
- Exploración de los efectos de la variación intracondición en conjuntos de datos de RNA-seq
- Ejemplo completo de datos de prueba dentro de la carpeta de descarga
- Archivo jar ejecutable, se ejecuta en cualquier plataforma
- Fácil de instalar, solo descomprime la carpeta
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Consola / Terminal
Lenguaje de programación
Java
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/tvscript/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
